Zona Franca figura con la mayor área protegida con 194 ha, por cuanto allí se ubica el humedal Meandro del Say, una parte del río Fucha y su ronda y, una gran zona del río Bogotá y su ronda, dentro del cual se ubica el parque Zona Franca. La UPZ Fontibón San Pablo registra 61 ha. de suelo protegido que comprende un sector del río Bogotá y su ronda. En la UPZ Capellanía se localiza el humedal que le da su nombre con una extensión de 24 ha. En la UPZ Granjas Techo se ubica gran parte del río Fucha y en las UPZ Modelia y Ciudad Salitre Occidental se localiza un gran sector del canal San Francisco.